Selección Mayor

El 30 de septiembre de 2009, Javier debutó con la Selección de fútbol de México ante Colombia. Aunque su equipo fue derrotado por 2-1, Javier dio una asistencia a Paul Aguilar para la anotación del único gol de la selección mexicana.

Su segundo partido con la selección fue ante Bolivia el 24 de febrero de 2010, en donde el «chicharito» debutó como goleador, al haber contribuido con un doblete en la goleada de la selección mexicana por 5-0.Su tercer gol con el «Tri» fue el 3 de marzo de 2010 ante Nueva Zelanda, en donde anotó el primer gol del encuentro al minuto 53.Al final, México se impuso por 2-0.Su cuarto gol con la selección mexicana ocurrió el 17 de marzo de 2010 ante Corea del Norte, al haber anotado al minuto 68 el gol que le dio la victoria a México por 2-1.El 26 de mayo de 2010, en un partido amistoso ante Holanda, anotó el gol de México, luego de entrar de cambio, en el que se impuso Holanda 2-1.